Secteur :

Île-de-France

Domaine de compétence :

Biotechnologies

Véhicule nécessaire :

Non

Ingénieur de recherche biologie – H/F – Ref : 2022-7606

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Descriptif de la mission

Ingénieur de recherche biologie

Notre Institut, centre de recherche Biomédical, contribue depuis plus de 130 ans à l'histoire de la science, de la médecine et de la santé publique avec une immense renommée. Fidèle à l'esprit humaniste de son fondateur, l'Institut défend le caractère avant-gardiste nécessaire à la conduite de recherches de pointe.
Scientifique ou non, vous souhaitez rejoindre une entreprise qui prône la diversité, internationale, guidée par la curiosité, et qui place l'humain au cœur de son projet stratégique ? Alors postulez à nos offres !

Sujet :
Séquençage métagénomique du microbiome de l'eau et comparaison des souches de Legionella isolées dans ce microbiome

Missions/Activités
L'équipe « Biologie des Bactéries Intracellulaires » est actuellement constituée de 14 membres. L'axe principal des recherches menées dans cette unité est l'étude des maladies infectieuses, en particulier la pathogenèse bactérienne. Nous utilisons les Legionella, bactéries environnementales qui parasitent les protozoaires libres mais sont capables d'infecter des cellules humaines en provoquant une pneumonie sévère. Ces bactéries sont utilisées comme outils pour étudier les interactions hôte/ pathogène, l'évolution de la virulence et les mécanismes de régulation permettant l'adaptation bactérienne à l'environnement et à l'hôte.

Notre objectif est de découvrir :
(i) les voies de l'hôte qui sont manipulées lors de l'infection,
(ii) les mécanismes appliqués par un pathogène bactérien pour établir une infection et provoquer une maladie,
(iii) la régulation de la virulence bactérienne
(iv) l'évolution d'une bactérie pathogène intracellulaire dans l'amibe et des macrophages humains.
Notre objectif est de comprendre les stratégies de pathogenèse bactérienne, mais aussi de déchiffrer les voies de l'hôte qui doivent être modifiées par un agent pathogène pour provoquer une maladie.

Vos missions principales :
Expériences microbiologiques, biologie moléculaire et bio-informatique de base :
- Traitement par métagénomique de gènes marqueurs d'échantillons d'eau pour analyser la population microbienne : extraction d'ADN, PCR, construction de librairies et séquençage
- Séquençage métagénomique Shotgun des populations microbiennes dans l'eau
- Analyse bioinformatique des séquences obtenues
- Participation (à définir) au processus d'échantillonnage : prélèvement d'échantillons et analyse des paramètres physiques et chimiques de l'eau

***ATTENTION, VOUS DEVEZ IMPERATIVEMENT POSTULER SUR LE LIEN QUE VOUS TROUVEREZ EN DESSOUS DE L'OFFRE***

Profil recherché 

Nous recherchons un étudiant qui connaisse les techniques des expériences de microbiologie et de biologie moléculaire de base : extraction d'ADN, PCR, mise en culture de bactéries, etc..
De plus, une expérience dans le domaine de la métagénomique et de la bioinformatique peut être très utile pour le projet, mais non exigée.

Compétences acquises à l'issue de votre stage/période d'apprentissage
L'étudiant doit connaître les techniques basiques de microbiologie/biologie moléculaire :
. Mise en culture de bactéries
. Extraction d'ADN
. Quantification d'ADN (nanodrop /Qbit)
. Purification d'ADN
. PCR
. Gel d'agarose

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Formation(s) associée(s)

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