Secteur :

Bretagne

Domaine de compétence :

Biotechnologies
Bureaux d'études - Informatique - Mathématiques
Chimie Analytique
Hydrologie
Qualité / Santé / Sécurité / Environnement

Véhicule nécessaire :

Non

Alternant – Biologie/Ecologie – Imagerie (H/F)

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Date de début du contrat

2024 09 02

Durée du contrat

24 mois

Descriptif de la mission

Reconnu dans le monde entier comme l’un des tous premiers instituts en sciences et technologies marines, notre institut s’inscrit dans une double perspective de développement durable et de science ouverte. Il mène des recherches, innove, produit des expertises pour protéger et restaurer l’océan, exploiter ses ressources de manière responsable, et partager les connaissances et les données marines afin de créer de nouvelles opportunités pour une croissance économique respectueuse du milieu marin.
Présents sur toutes les façades maritimes de l’hexagone et des outremers, ses laboratoires sont implantés sur une vingtaine de sites dans les trois grands océans : l’océan Indien, l’Atlantique et le Pacifique.
Pour le compte de l’Etat, l'Institut opère la Flotte océanographique française au bénéfice de la communauté scientifique nationale. Il conçoit ses propres engins et équipements de pointe pour explorer et observer l’océan, du littoral au grand large et des abysses à l’interface avec l’atmosphère.
Ouverts sur la communauté scientifique internationale, ses 1500 chercheurs, ingénieurs et techniciens font progresser les connaissances sur l’une des dernières frontières inexplorées de notre planète ; ils contribuent à éclairer les politiques publiques et à l’innovation pour une économie bleue durable. Leur mission consiste aussi à sensibiliser le grand public aux enjeux maritimes.
Fondé en 1984, l'Institut est un établissement public à caractère industriel et commercial (EPIC), dont le budget avoisine 240 millions d’Euros. Il est placé sous la tutelle du ministre chargé de la recherche, du ministre chargé de la mer et du ministre chargé de l'environnement.

Les écosystèmes marins profonds recèlent une forte diversité biologique liée à la variabilité des environnements benthiques. La biodiversité et la dynamique de ces écosystèmes à l’état naturel sont encore bien mal connues, pourtant ils font l’objet d’un intérêt croissant pour l’exploitation des ressources naturelles qu’ils abritent. C’est pourquoi notre Unité développe des projets de recherche destinés à acquérir des connaissances sur la biodiversité et le fonctionnement de ces écosystèmes afin de contribuer à proposer des solutions pour une exploitation responsable de leurs ressources.

L'utilisation de l'imagerie comme méthode d'étude des écosystèmes profonds (faune et habitat) s'est généralisée au Laboratoire , avec une acquisition régulière dans l’espace, le long de transects d’engins sous-marins ou caméras tractées, ou par le biais d’observatoires fond de mer pour des suivis temporels (observatoires fonds de mers EMSO-Açores, MARLEY et ScInObs, campagnes annuelles). L’analyse de ce type de données représente une activité importante du laboratoire au sein duquel vous serez placé(e) sous la responsabilité de l’ingénieure biologiste imagerie. Vous bénéficierez de l'encadrement des chercheurs en écologie benthique du laboratoire et profiterez d'interactions avec les équipes responsables des développements techniques associés (logiciels spécifiques, capteurs, gestion de données).

Missions principales :

Vous participerez à l’exploitation de jeux de données d’images et de vidéos sous-marines ainsi qu’à la mise en place d'une gestion de données adaptée à l'imagerie. Vous travaillerez sur tous les chantiers clés du département (Golfe de Gascogne, dorsale médio-Atlantique, Pacifique Ouest) et contribuerez à la caractérisation de la structuration spatio-temporelle des communautés benthiques dans le cadre de nos projets

Activités principales :

Traitement d'images ou vidéos en vue de différentes applications (ex : construction de mosaïques 2D, modèles 3D par logiciels existants, extractions d’images) ;
Annotation et analyse d'images ou vidéos manuelle et automatisée : tests pour l'automatisation, préparation de jeux de données d'entrainement, test d'algorithmes de type machine- ou deep-learning ;
Post-traitement des données extraites de l'imagerie (ex : géoréférencement sous SIG, recalages de modèles 3D) ;
Participation à la gestion des données d'imagerie.

***INFORMATION CANDIDATURE POUR LES ADMISSIBLES A LA (AUX) FORMATION(S) ASSOCIEE(S), VOUS DEVREZ IMPERATIVEMENT POSTULER EN PARALLELE SUR LE LIEN QUE VOUS TROUVEREZ EN DESSOUS DE L'OFFRE SUR VOTRE ESPACE CANDIDAT****

Profil recherché 

L’offre vise une formation BAC + 2 à BAC + 3 en biologie/écologie/génie biologique

Connaissance des grands groupes taxonomiques marins
Connaissance en biologie marine
Intérêt pour l’écologie marine
Aisance dans la prise en main de nouveaux logiciels/outils informatiques
Expérience en analyse d’images appréciée (et éventuellement SIG)
Qualités personnelles

Rigueur et méthode
Capacité d’analyse
Autonomie et esprit d’initiative
Sens de l’organisation et de la planification
Excellent relationnel, capacité à travailler en équipe

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